Главный герой фильма — американец Джо по прозвищу «американский ниндзя». Раньше он учился боевым искусствам у мастера Тэцу, а сейчас он сам должен стать учителем. Ему в попечение достаётся племянник мастера Тэцу мальчик Хиро. Хиро увлекается компьютерами, а восточные единоборства его совсем не интересуют. Но Джо всё-таки преподаёт ему несколько уроков.
Джо и Хиро знакомятся с молодой девушкой Лизой. Отец Лизы — известный учёный. Через некоторое время Лизу похищают. Цель похищения — шантаж её отца-учёного. Теперь Джо опираясь на своего юного ученика, должен снова победить злодеев и вызволить девушку из плена.
